Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREM2Q9NZC2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREM2Q9NZC2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREM2Q9NZC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TREM2Q9NZC2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREM2Q9NZC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREM2Q9NZC2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TREM2Q9NZC2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREM2Q9NZC2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms