Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
MIS18AQ9NYP9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MIS18AQ9NYP9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
MIS18AQ9NYP9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MIS18AQ9NYP9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
MIS18AQ9NYP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MIS18AQ9NYP9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MIS18AQ9NYP9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MIS18AQ9NYP9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MIS18AQ9NYP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
MIS18AQ9NYP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MIS18AQ9NYP9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms