Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBA8Q9NY65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBA8Q9NY65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBA8Q9NY65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBA8Q9NY65 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBA8Q9NY65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA8Q9NY65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA8Q9NY65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA8Q9NY65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms