Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TUBA8Q9NY65 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TUBA8Q9NY65 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBA8Q9NY65 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TUBA8Q9NY65 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TUBA8Q9NY65 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TUBA8Q9NY65 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TUBA8Q9NY65 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TUBA8Q9NY65 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBA8Q9NY65 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TUBA8Q9NY65 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBA8Q9NY65 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUBA8Q9NY65 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TUBA8Q9NY65 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TUBA8Q9NY65 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TUBA8Q9NY65 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TUBA8Q9NY65 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TUBA8Q9NY65 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBA8Q9NY65 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBA8Q9NY65 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBA8Q9NY65 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBA8Q9NY65 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBA8Q9NY65 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBA8Q9NY65 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TUBA8Q9NY65 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBA8Q9NY65 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBA8Q9NY65 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBA8Q9NY65 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TUBA8Q9NY65 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBA8Q9NY65 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBA8Q9NY65 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBA8Q9NY65 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBA8Q9NY65 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBA8Q9NY65 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBA8Q9NY65 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBA8Q9NY65 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBA8Q9NY65 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBA8Q9NY65 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TUBA8Q9NY65 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBA8Q9NY65 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBA8Q9NY65 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBA8Q9NY65 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBA8Q9NY65 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBA8Q9NY65 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBA8Q9NY65 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBA8Q9NY65 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBA8Q9NY65 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBA8Q9NY65 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBA8Q9NY65 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBA8Q9NY65 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBA8Q9NY65 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBA8Q9NY65 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBA8Q9NY65 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBA8Q9NY65 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBA8Q9NY65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBA8Q9NY65 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBA8Q9NY65 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBA8Q9NY65 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBA8Q9NY65 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA8Q9NY65 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBA8Q9NY65 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBA8Q9NY65 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBA8Q9NY65 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBA8Q9NY65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBA8Q9NY65 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBA8Q9NY65 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBA8Q9NY65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBA8Q9NY65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBA8Q9NY65 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBA8Q9NY65 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBA8Q9NY65 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBA8Q9NY65 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA8Q9NY65 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBA8Q9NY65 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBA8Q9NY65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBA8Q9NY65 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBA8Q9NY65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBA8Q9NY65 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA8Q9NY65 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBA8Q9NY65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBA8Q9NY65 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBA8Q9NY65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBA8Q9NY65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBA8Q9NY65 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBA8Q9NY65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBA8Q9NY65 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBA8Q9NY65 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA8Q9NY65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA8Q9NY65 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA8Q9NY65 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms