Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRNAU1APQ9NX07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRNAU1APQ9NX07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRNAU1APQ9NX07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRNAU1APQ9NX07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRNAU1APQ9NX07 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRNAU1APQ9NX07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRNAU1APQ9NX07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRNAU1APQ9NX07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRNAU1APQ9NX07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms