Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRGBPQ9NV56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRGBPQ9NV56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRGBPQ9NV56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRGBPQ9NV56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRGBPQ9NV56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRGBPQ9NV56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRGBPQ9NV56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRGBPQ9NV56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRGBPQ9NV56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms