Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EMILIN3Q9NT22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EMILIN3Q9NT22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EMILIN3Q9NT22 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EMILIN3Q9NT22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
EMILIN3Q9NT22 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EMILIN3Q9NT22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EMILIN3Q9NT22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EMILIN3Q9NT22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
EMILIN3Q9NT22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
EMILIN3Q9NT22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EMILIN3Q9NT22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EMILIN3Q9NT22 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
EMILIN3Q9NT22 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EMILIN3Q9NT22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
EMILIN3Q9NT22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EMILIN3Q9NT22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EMILIN3Q9NT22 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EMILIN3Q9NT22 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms