Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
RRP7BPQ9NSQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RRP7BPQ9NSQ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RRP7BPQ9NSQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RRP7BPQ9NSQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms