Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS45Q9NRW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS45Q9NRW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS45Q9NRW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VPS45Q9NRW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS45Q9NRW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS45Q9NRW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS45Q9NRW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS45Q9NRW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms