Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A5Q9NRA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC17A5Q9NRA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC17A5Q9NRA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC17A5Q9NRA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC17A5Q9NRA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A5Q9NRA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A5Q9NRA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC17A5Q9NRA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms