Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR99

MXRA5, Matrix-remodeling-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA5Q9NR99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MXRA5Q9NR99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MXRA5Q9NR99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MXRA5Q9NR99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MXRA5Q9NR99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MXRA5Q9NR99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MXRA5Q9NR99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MXRA5Q9NR99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MXRA5Q9NR99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms