Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARP11Q9NR21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARP11Q9NR21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP11Q9NR21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP11Q9NR21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP11Q9NR21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PARP11Q9NR21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms