Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INCENPQ9NQS7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
INCENPQ9NQS7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INCENPQ9NQS7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
INCENPQ9NQS7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
INCENPQ9NQS7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
INCENPQ9NQS7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
INCENPQ9NQS7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INCENPQ9NQS7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
INCENPQ9NQS7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
INCENPQ9NQS7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
INCENPQ9NQS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
INCENPQ9NQS7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
INCENPQ9NQS7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INCENPQ9NQS7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms