Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCUBE2Q9NQ36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCUBE2Q9NQ36 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCUBE2Q9NQ36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCUBE2Q9NQ36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCUBE2Q9NQ36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCUBE2Q9NQ36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCUBE2Q9NQ36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms