Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBN1Q9NPG3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBN1Q9NPG3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
UBN1Q9NPG3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBN1Q9NPG3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBN1Q9NPG3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBN1Q9NPG3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBN1Q9NPG3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBN1Q9NPG3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBN1Q9NPG3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms