Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A4GALTQ9NPC4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A4GALTQ9NPC4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A4GALTQ9NPC4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A4GALTQ9NPC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
A4GALTQ9NPC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A4GALTQ9NPC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms