Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD20

ATP13A1, Manganese-transporting ATPase 13A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A1Q9HD20 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP13A1Q9HD20 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms