Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD20

ATP13A1, Manganese-transporting ATPase 13A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A1Q9HD20 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP13A1Q9HD20 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP13A1Q9HD20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP13A1Q9HD20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP13A1Q9HD20 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP13A1Q9HD20 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP13A1Q9HD20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP13A1Q9HD20 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A1Q9HD20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A1Q9HD20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms