Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF556Q9HAH1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF556Q9HAH1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF556Q9HAH1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF556Q9HAH1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF556Q9HAH1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF556Q9HAH1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF556Q9HAH1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF556Q9HAH1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms