Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA72

CALHM2, Calcium homeostasis modulator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALHM2Q9HA72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALHM2Q9HA72 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALHM2Q9HA72 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALHM2Q9HA72 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALHM2Q9HA72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALHM2Q9HA72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALHM2Q9HA72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALHM2Q9HA72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALHM2Q9HA72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALHM2Q9HA72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms