Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REEP1Q9H902 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
REEP1Q9H902 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP1Q9H902 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP1Q9H902 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
REEP1Q9H902 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
REEP1Q9H902 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REEP1Q9H902 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REEP1Q9H902 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms