Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VRTNQ9H8Y1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VRTNQ9H8Y1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VRTNQ9H8Y1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VRTNQ9H8Y1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VRTNQ9H8Y1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VRTNQ9H8Y1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VRTNQ9H8Y1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VRTNQ9H8Y1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VRTNQ9H8Y1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms