Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7R0

ZNF442, Zinc finger protein 442, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF442Q9H7R0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF442Q9H7R0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF442Q9H7R0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF442Q9H7R0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF442Q9H7R0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF442Q9H7R0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF442Q9H7R0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF442Q9H7R0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF442Q9H7R0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF442Q9H7R0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF442Q9H7R0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms