Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMYD3Q9H7B4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMYD3Q9H7B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMYD3Q9H7B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMYD3Q9H7B4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMYD3Q9H7B4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMYD3Q9H7B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMYD3Q9H7B4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMYD3Q9H7B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMYD3Q9H7B4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMYD3Q9H7B4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMYD3Q9H7B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMYD3Q9H7B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMYD3Q9H7B4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms