Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C5orf42Q9H799 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C5orf42Q9H799 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C5orf42Q9H799 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
C5orf42Q9H799 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C5orf42Q9H799 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
C5orf42Q9H799 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
C5orf42Q9H799 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C5orf42Q9H799 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C5orf42Q9H799 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
C5orf42Q9H799 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C5orf42Q9H799 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C5orf42Q9H799 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C5orf42Q9H799 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C5orf42Q9H799 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms