Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RETREG1Q9H6L5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RETREG1Q9H6L5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETREG1Q9H6L5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RETREG1Q9H6L5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETREG1Q9H6L5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETREG1Q9H6L5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RETREG1Q9H6L5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RETREG1Q9H6L5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RETREG1Q9H6L5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RETREG1Q9H6L5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RETREG1Q9H6L5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETREG1Q9H6L5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms