Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LSG1Q9H089 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LSG1Q9H089 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LSG1Q9H089 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LSG1Q9H089 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LSG1Q9H089 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LSG1Q9H089 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LSG1Q9H089 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LSG1Q9H089 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LSG1Q9H089 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LSG1Q9H089 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LSG1Q9H089 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LSG1Q9H089 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LSG1Q9H089 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LSG1Q9H089 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LSG1Q9H089 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms