Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPRTNQ9H040 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRTNQ9H040 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRTNQ9H040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRTNQ9H040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRTNQ9H040 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRTNQ9H040 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPRTNQ9H040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPRTNQ9H040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms