Protein–RNA interactions for Protein: Q9C010

PKIB, cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIBQ9C010 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKIBQ9C010 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKIBQ9C010 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKIBQ9C010 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKIBQ9C010 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKIBQ9C010 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKIBQ9C010 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKIBQ9C010 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKIBQ9C010 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms