Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.06■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
HIRIP3Q9BW71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HIRIP3Q9BW71 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
HIRIP3Q9BW71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
HIRIP3Q9BW71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
HIRIP3Q9BW71 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
HIRIP3Q9BW71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
HIRIP3Q9BW71 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HIRIP3Q9BW71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
HIRIP3Q9BW71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
HIRIP3Q9BW71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
HIRIP3Q9BW71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HIRIP3Q9BW71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
HIRIP3Q9BW71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HIRIP3Q9BW71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms