Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MTA3Q9BTC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MTA3Q9BTC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MTA3Q9BTC8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MTA3Q9BTC8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MTA3Q9BTC8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MTA3Q9BTC8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MTA3Q9BTC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MTA3Q9BTC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms