Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF1Q9BSM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF1Q9BSM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF1Q9BSM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF1Q9BSM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF1Q9BSM1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCGF1Q9BSM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCGF1Q9BSM1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms