Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM246Q9BRR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM246Q9BRR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM246Q9BRR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM246Q9BRR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM246Q9BRR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM246Q9BRR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM246Q9BRR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms