Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDF4Q9BRK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SDF4Q9BRK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SDF4Q9BRK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SDF4Q9BRK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDF4Q9BRK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDF4Q9BRK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDF4Q9BRK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SDF4Q9BRK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SDF4Q9BRK5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDF4Q9BRK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SDF4Q9BRK5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDF4Q9BRK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SDF4Q9BRK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDF4Q9BRK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SDF4Q9BRK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SDF4Q9BRK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SDF4Q9BRK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SDF4Q9BRK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms