Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 B4GALNT4-202ENST00000524443 420 ntTSL 320.25■□□□□ 0.833e-8■■■■■ 30.6
GRWD1Q9BQ67 MKI67-203ENST00000464771 692 ntTSL 314.55□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.42e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 MARK3-213ENST00000558611 687 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-FNTB-203ENST00000552941 1847 ntTSL 218.55■□□□□ 0.565e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-207ENST00000556089 571 ntTSL 217.46■□□□□ 0.395e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-FNTB-201ENST00000549987 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-204ENST00000551093 1023 ntTSL 216.19■□□□□ 0.185e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 DAB2IP-207ENST00000459906 485 ntTSL 315.99■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-205ENST00000551947 1521 ntTSL 213.64□□□□□ -0.235e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.295e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 SEC24D-210ENST00000511033 576 ntTSL 413.13□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-206ENST00000552002 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 KIAA0753-202ENST00000542826 1572 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 KIAA0753-209ENST00000575027 753 ntTSL 410.89□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.765e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.785e-11■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 KIAA0753-210ENST00000576281 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.19□□□□□ -0.942e-9■■■■■ 30.5
GRWD1Q9BQ67 MAST2-210ENST00000498668 346 ntTSL 318.8■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.736e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)30.39■■■□□ 2.466e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 322.21■■□□□ 1.156e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-207ENST00000493672 329 ntTSL 518.58■□□□□ 0.566e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 SNRNP25-204ENST00000417493 408 ntTSL 516.67■□□□□ 0.266e-9■■■■■ 30.4
GRWD1Q9BQ67 ITSN1-221ENST00000456489 485 ntTSL 213.78□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-204ENST00000505768 772 ntTSL 329.09■■■□□ 2.252e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.172e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-206ENST00000507506 988 ntTSL 226.94■■□□□ 1.92e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-203ENST00000505136 717 ntTSL 526.6■■□□□ 1.852e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.662e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-208ENST00000511276 571 ntTSL 421.18■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 RSF1-209ENST00000531026 830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-210ENST00000512180 558 ntTSL 418.3■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 FAM53C-207ENST00000511024 1882 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-211ENST00000589947 670 ntTSL 420.03■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-207ENST00000587638 1111 ntTSL 216.75■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-208ENST00000587709 3751 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-202ENST00000262816 3838 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-213ENST00000590882 553 ntTSL 413.59□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MAU2-206ENST00000587362 557 ntTSL 49.84□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 30.3
GRWD1Q9BQ67 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 226.37■■□□□ 1.812e-8■■■■■ 30.2
GRWD1Q9BQ67 THOC1-203ENST00000577552 912 ntTSL 518.83■□□□□ 0.69e-9■■■■■ 30.2
GRWD1Q9BQ67 KYNU-204ENST00000410015 776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.099e-9■■■■■ 30.2
GRWD1Q9BQ67 KYNU-205ENST00000424385 636 ntTSL 311.48□□□□□ -0.579e-9■■■■■ 30.2
GRWD1Q9BQ67 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 30.1
GRWD1Q9BQ67 LIG1-219ENST00000600055 602 ntTSL 223.17■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 30.1
GRWD1Q9BQ67 DUSP6-205ENST00000548755 567 ntTSL 425.84■■□□□ 1.736e-9■■■■■ 30.1
GRWD1Q9BQ67 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.116e-9■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-9■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-205ENST00000460654 830 ntTSL 322.12■■□□□ 1.136e-7■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 CWC25-207ENST00000622665 976 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 RRP15-202ENST00000491428 492 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 30
GRWD1Q9BQ67 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC13.52□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 29.9
GRWD1Q9BQ67 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.033e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 33e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 33e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 PHF12-211ENST00000582853 555 ntTSL 430.86■■■□□ 2.533e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.163e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.163e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.643e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 TRAF3IP1-204ENST00000462122 922 ntTSL 317.54■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 KIF2C-205ENST00000455186 908 ntTSL 517.22■□□□□ 0.353e-12■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 FGFR1-236ENST00000531196 842 ntTSL 316.9■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 513.38□□□□□ -0.273e-12■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 KIF2C-204ENST00000452259 1124 ntTSL 512.19□□□□□ -0.463e-12■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 CALD1-215ENST00000472096 651 ntTSL 223.01■■□□□ 1.271e-11■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 29.56□□□□□ -0.882e-82■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 ARIH2-229ENST00000495507 112 ntTSL 53.91□□□□□ -1.783e-24■■■■■ 29.8
GRWD1Q9BQ67 MACF1-207ENST00000442046 2299 ntTSL 519.46■□□□□ 0.716e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 MFN1-209ENST00000489329 543 ntTSL 419.05■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 FAM193A-206ENST00000506904 533 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 OPTN-211ENST00000486862 423 ntTSL 315.73■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 VPS9D1-205ENST00000565452 178 ntTSL 314.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 MFN1-206ENST00000474903 1919 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 MFN1-202ENST00000357390 3148 ntTSL 29.36□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.052e-29■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 310.08□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 29.7
GRWD1Q9BQ67 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 520.21■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 29.6
GRWD1Q9BQ67 EEF2K-203ENST00000563555 610 ntTSL 59.47□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 29.6
GRWD1Q9BQ67 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.484e-10■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-202ENST00000543014 2055 ntTSL 227.62■■■□□ 2.011e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-206ENST00000584342 828 ntTSL 226.39■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-203ENST00000579060 647 ntTSL 326■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 ANLN-210ENST00000457743 757 ntTSL 517.77■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-201ENST00000268766 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-204ENST00000579671 643 ntTSL 310.39□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 NEK8-208ENST00000593261 547 ntTSL 39.06□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 G2E3-210ENST00000552488 786 ntTSL 318.72■□□□□ 0.595e-9■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 G2E3-214ENST00000555429 411 ntTSL 513.38□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 G2E3-209ENST00000550944 565 ntTSL 213.38□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 212.61□□□□□ -0.395e-22■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 DNMT1-209ENST00000586799 672 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 29.5
GRWD1Q9BQ67 SMARCC1-207ENST00000485833 412 ntTSL 517.46■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 29.5
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