Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCAPGQ9BPX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCAPGQ9BPX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCAPGQ9BPX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCAPGQ9BPX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCAPGQ9BPX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCAPGQ9BPX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCAPGQ9BPX3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCAPGQ9BPX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCAPGQ9BPX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCAPGQ9BPX3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCAPGQ9BPX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCAPGQ9BPX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPGQ9BPX3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPGQ9BPX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPGQ9BPX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPGQ9BPX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms