Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSG101Q99816 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSG101Q99816 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSG101Q99816 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TSG101Q99816 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSG101Q99816 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSG101Q99816 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSG101Q99816 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSG101Q99816 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSG101Q99816 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSG101Q99816 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSG101Q99816 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TSG101Q99816 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSG101Q99816 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TSG101Q99816 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSG101Q99816 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSG101Q99816 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms