Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIMP4Q99727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMP4Q99727 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMP4Q99727 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMP4Q99727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMP4Q99727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMP4Q99727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP4Q99727 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP4Q99727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP4Q99727 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms