Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC1Q99614 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC1Q99614 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC1Q99614 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC1Q99614 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC1Q99614 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC1Q99614 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC1Q99614 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC1Q99614 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC1Q99614 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC1Q99614 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC1Q99614 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC1Q99614 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC1Q99614 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC1Q99614 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms