Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CD180Q99467 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD180Q99467 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD180Q99467 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD180Q99467 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD180Q99467 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD180Q99467 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD180Q99467 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD180Q99467 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CD180Q99467 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD180Q99467 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CD180Q99467 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD180Q99467 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD180Q99467 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD180Q99467 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD180Q99467 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD180Q99467 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD180Q99467 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD180Q99467 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD180Q99467 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD180Q99467 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD180Q99467 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD180Q99467 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD180Q99467 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD180Q99467 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD180Q99467 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CD180Q99467 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CD180Q99467 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD180Q99467 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD180Q99467 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD180Q99467 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD180Q99467 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CD180Q99467 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD180Q99467 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD180Q99467 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD180Q99467 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD180Q99467 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD180Q99467 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD180Q99467 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD180Q99467 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD180Q99467 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD180Q99467 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CD180Q99467 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD180Q99467 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD180Q99467 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD180Q99467 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CD180Q99467 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD180Q99467 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CD180Q99467 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD180Q99467 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD180Q99467 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD180Q99467 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD180Q99467 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD180Q99467 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD180Q99467 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD180Q99467 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD180Q99467 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD180Q99467 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD180Q99467 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD180Q99467 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD180Q99467 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD180Q99467 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD180Q99467 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD180Q99467 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD180Q99467 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD180Q99467 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD180Q99467 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD180Q99467 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD180Q99467 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD180Q99467 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD180Q99467 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD180Q99467 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD180Q99467 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD180Q99467 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD180Q99467 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD180Q99467 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD180Q99467 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD180Q99467 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD180Q99467 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD180Q99467 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD180Q99467 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD180Q99467 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD180Q99467 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD180Q99467 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD180Q99467 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD180Q99467 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD180Q99467 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD180Q99467 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD180Q99467 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD180Q99467 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD180Q99467 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD180Q99467 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD180Q99467 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms