Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NELL2Q99435 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NELL2Q99435 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NELL2Q99435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NELL2Q99435 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NELL2Q99435 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELL2Q99435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NELL2Q99435 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NELL2Q99435 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELL2Q99435 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NELL2Q99435 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NELL2Q99435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NELL2Q99435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NELL2Q99435 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NELL2Q99435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NELL2Q99435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NELL2Q99435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NELL2Q99435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NELL2Q99435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NELL2Q99435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NELL2Q99435 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NELL2Q99435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NELL2Q99435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NELL2Q99435 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms