Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HAPLN3Q96S86 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HAPLN3Q96S86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HAPLN3Q96S86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HAPLN3Q96S86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HAPLN3Q96S86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HAPLN3Q96S86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HAPLN3Q96S86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HAPLN3Q96S86 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HAPLN3Q96S86 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HAPLN3Q96S86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms