Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A2Q96QD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A2Q96QD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC38A2Q96QD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC38A2Q96QD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC38A2Q96QD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC38A2Q96QD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC38A2Q96QD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms