Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPRR4Q96PI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPRR4Q96PI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPRR4Q96PI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPRR4Q96PI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPRR4Q96PI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRR4Q96PI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPRR4Q96PI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms