Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN4Q96NZ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXN4Q96NZ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXN4Q96NZ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXN4Q96NZ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXN4Q96NZ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXN4Q96NZ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXN4Q96NZ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXN4Q96NZ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms