Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NECTIN4Q96NY8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN4Q96NY8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN4Q96NY8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN4Q96NY8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NECTIN4Q96NY8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECTIN4Q96NY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NECTIN4Q96NY8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NECTIN4Q96NY8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NECTIN4Q96NY8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NECTIN4Q96NY8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NECTIN4Q96NY8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NECTIN4Q96NY8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms