Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JSRP1Q96MG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
JSRP1Q96MG2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JSRP1Q96MG2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JSRP1Q96MG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JSRP1Q96MG2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JSRP1Q96MG2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JSRP1Q96MG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JSRP1Q96MG2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JSRP1Q96MG2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
JSRP1Q96MG2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms