Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRIMPOLQ96LW4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRIMPOLQ96LW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRIMPOLQ96LW4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRIMPOLQ96LW4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PRIMPOLQ96LW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
PRIMPOLQ96LW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRIMPOLQ96LW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRIMPOLQ96LW4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PRIMPOLQ96LW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRIMPOLQ96LW4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms