Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOVQ96L33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOVQ96L33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOVQ96L33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOVQ96L33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOVQ96L33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOVQ96L33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOVQ96L33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms