Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPGRIP1Q96KN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPGRIP1Q96KN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPGRIP1Q96KN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPGRIP1Q96KN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPGRIP1Q96KN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPGRIP1Q96KN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPGRIP1Q96KN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPGRIP1Q96KN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPGRIP1Q96KN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms