Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS50Q96JG6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS50Q96JG6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS50Q96JG6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS50Q96JG6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS50Q96JG6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS50Q96JG6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS50Q96JG6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS50Q96JG6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS50Q96JG6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS50Q96JG6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS50Q96JG6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms